气候
三清山为中亚热带季风气候类型，具有温和多雨，四季分明的特征。山区垂直地带性气候明显，从山麓到山顶，具有高山气候变化。平均气温为10.9℃，年温差为21℃。1月份气温平均为零下6℃，最低气温为—7℃；7月份平均气温为22℃，最高气温为35℃。相对湿度较大，早晚温差较大。
动植物资源
春来繁花似锦、姹紫嫣红；夏近绿荫飘浮、清爽宜人；秋去红叶尽染、色彩斑斓；冬至雪盖冰挂、玉树琼花，这正是三清山优越生态环境条件下充满生机与灵气的生态景观的真实写照。
三清山的生物世界经历了两亿多年来的演化更替，孕育了现代三清山独特的中亚热带东方湿润常绿阔叶林生态系统，保存有以常绿阔叶林、常绿阔叶和落叶阔叶混交林、暖温性常绿针阔叶混交林、暖温性针叶林和矮曲林为主的 9 个植被类型，拥有高等植物 2373 种、野生动物1728种。其中有 45 动植物列入 IUCN 物种红色名录、146 种动植物列入《濒危野生动植物种国际贸易公约》CITES 附录、144 种动植物列入《中国物种红色名录》、79 种动植物列为中国国家重点保护野生物种。在第四纪时期，三清山没有受到山岳冰川的侵袭，成为许多古老植物的避难所，使世界珍稀古老植物群落和物种的多样性得以遗存，也使三清山成了世界上不可多得的原生态生物乐园。在东亚-北美间断分布植物中，中国有 117 属，三清山有 68 属、占中国该类型属数的58%。这里保存有华东黄杉、南方铁杉、鹅掌楸、白豆杉、南方红豆杉、黄腹角雉、白颈长尾雉、黑麂等珍稀濒危物种。特别是与北美花旗杉相对应的华东黄杉，在三清山有成林面积533 公顷，与北美鹅掌楸相对应的中国鹅掌楸在这里成片分布。因此，三清山除了地质科学和地貌科学的重要价值外，还拥有突出的生物学和生态学价值。三清山地质公园为人们研究物种发育、物种进化和森林生态过程提供了一个超大时空尺度的“天然监护室”，也为东亚与北美洲两大陆的地质演化、古地理环境变迁、生物演替等自然演化历史的对比研究提供了一个重要园地。
