三清山气候终年温和湿润，空气清新，气候宜人，具亚热带气候特征。气候随海拔和地形变化而异，具山地特征。年干均气温约17.2度，1月平均气温0.6度，7月平均气温21.1度。无炎夏感暑，一般暑天山上气温比山下低7-8度，为天然避暑胜地。雨量充沛，湿度大，雾日多，年平均降雨量2100毫米以上，年平均相对湿度82%。年雾日215天左右。云雾变幻，成为山上一大奇观。平均无霜期250天，年平均日照时数1937. 3小时，年平均地温13. 6度，地表水，枯水期为179. 32万立方米，丰水期为593.64 万立方米。
