三清山风景区医疗卫生事业取得长足发展。2000 年之前，三清山仅有一个三清乡乡级卫生院,医疗条件简陋，地方性传染病和查螺灭螺任务重。通过疾病防治宣传、群众性爱国卫生运动和健康教育，卫生面貌得到极大改善。人民健康水平得到提高。加强与市、县卫生防疫工作联动,中村、中关、柴门、枫林等地的有螺面积得到有效控制。2015 年实现村级卫生服务室全覆盖。2016年对三清乡卫生院实施搬迁改造设外科、内科、妇产科、儿科4个科室,有医务人员11人。同年12月建成现代化医疗设施的三清山枫林医院。2017 年7月,三清山管委会创新管理方式，与上饶市立医院共建上饶市立医院三清山分院。设有常规科室、手术室，开设特色专科和中医养生馆,有医务人员21人,其中副主任医师1人，主治医生2人。承担枫林办事处1.2万余群众看病就医的基本医疗、计划免疫、住院分娩、爱国卫生运动的技术指导和居民公共卫生健康扶贫等工作。同时承担外双溪接待区和南部景区游客医疗急救任务，保障游客生命财产安全。至2018年，辖区每1000人口拥有医院病床数从1996年的1.2张，提升到4.2张。1996- -2018 年间，累计投入卫生事业费8112万元。
